Наруто: Путь становления ниндзя

Шестнадцать лет назад, загадочный ниндзя в маске спустил сильнейшее существо, известное как Девятихвостый демонический лис, на деревню Коноха, убив, тем самым, много людей. В ответ глава ниндзя Конохи, четвёртый Хокагэ, Минато Намикадзэ со своей женой Кусиной Удзумаки, живой тюрьмой для демонического лиса, запечатывают лиса в теле своего новорождённого сына Наруто Удзумаки.

После запечатывания хвостатого зверя, жизнь возвращается к норме. Однако, в настоящем, спокойствие заканчивается после нападение на Коноху группы ниндзя под названием Акацуки, под командование Тоби, загадочного человека в маске, стоящего за неистовством девятихвостого лиса много лет назад.

Тоби планирует править миром, погружённым в иллюзии. Наруто и Сакура попадают в гэндзюцу Тоби и перемещаются в параллельный мир, где многие из тех, кого они знают, поменяли своё отношение к миру, где родители Наруто живы, а родители Сакуры погибли.